Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOEP02649 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOEP02649 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOEP02649 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms