Protein–RNA interactions for Protein: P01127

PDGFB, Platelet-derived growth factor subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFBP01127 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDGFBP01127 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDGFBP01127 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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