Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMTA2O94983 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms