Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms