Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CALUO43852 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CALUO43852 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CALUO43852 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms