Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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