Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS3Q9UNS2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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