Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms