Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APEX2Q9UBZ4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms