Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PEMTQ9UBM1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms