Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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