Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms