Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms