Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms