Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms