Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ULK4Q96C45 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ULK4Q96C45 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms