Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms