Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF3C6Q969F1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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