Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms