Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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