Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ATG16L1Q676U5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG16L1Q676U5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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