Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHYHD1Q5SRE7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms