Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms