Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCAF6Q58WW2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms