Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SFT2D3Q587I9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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