Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP28Q4G0W2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms