Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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