Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NR1D2Q14995 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms