Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms