Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMC1AQ14683 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMC1AQ14683 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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