Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms