Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms