Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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