Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms