Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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