Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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