Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms