Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms