Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RBBP4Q09028 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms