Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRP1Q07954 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms