Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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TFF3Q07654 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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TFF3Q07654 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TFF3Q07654 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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