Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC006378.1-201ENST00000426193 563 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC002384.1-202ENST00000470135 673 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms