Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms