Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP7AQ04656 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP7AQ04656 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP7AQ04656 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP7AQ04656 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms