Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms