Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms