Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RAB4BP61018 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB4BP61018 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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