Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3BP58499 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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