Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AQP4P55087 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms