Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP4P49662 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms